增值税暂行条例第二十二条规定，增值税纳税地点为：固定业户应当向其机构所在地的主管税务机关申报纳税。总机构和分支机构不在同一县（市）的，应当分别向各自所在地的主管税务机关申报纳税；经国务院财政、税务主管部门或者其授权的财政、税务机关批准，可以由总机构汇总向总机构所在地的主管税务机关申报纳税。

     根据上述规定，总分机构应由不同税务机关管理，使用不同的税号，应当分别向各自所在地的主管税务机关申报纳税。

     因此，外地加油站的增值税专用发票，不能由总公司代开。

      如果企业经国务院财政、税务主管部门或者其授权的财政、税务机关批准，可以由总机构汇总统一开具发票，向总机构所在地主管税务机关统一申报纳税。